5月3日袁以大总统名义，通令严捕图谋内乱党徒：
“……近阅上海四月廿九日路透电，称有人在沪运动第二次革命，谆劝商家助捐筹饷，反对中央。又英文《大陆报》称上海有人运动沪宁铁路，预备运兵赴宁各等语。被阅之余，殊堪骇怪，虽西报登载，风闻不必实有其事，而既有此等传说，岂容坐视乱萌。
用特明切宣示，昭告国民，须知总统向称公仆，与子孙帝王万世之业，劳逸迥殊，但使众望久孚，即能被选，何用借端发难，苦我生灵。倘如西报所言，jian人乘此煽乱，酿成bào动，则是扰乱和平，破坏民国，甘冒天下之不韪。本大总统一日在任，即有捍卫疆土、保护人民之责，惟有除bào安良，执法不贷。为此令行各省都督、民政长，转令各地方长官，遇有不逞之徒，潜谋内乱，敛财聚众，确有实据，立予逮捕严究。其有无知愚民，或被人诱胁，或转相惊扰者，一并婉为开导，毋得稍涉株连。特此通令知照。此令。”
同日又通令各省维持治安：
“……近日迭接各处电文，语极离奇，淆人耳目。一为前农林总长宋教仁被刺案，因洪述祖与应夔丞往来函件，影she国务总理赵秉钧；一为五国借款告成，误认议院未经通过，并疑及监督财政，市虎杯蛇，深堪骇异。宋教仁被刺一案，业经赵秉钧通告说明，五国借款一案，亦由财政总长详细宣布，阅者酌理准情，当能了然于两事之真相。乃有不问是非，不顾虚实，竟将立法、行政、司法各机关一笔抹倒，凭个人之成见，qiáng举世以盲从，直欲酿成绝大风cháo，以遂其倾覆政府，扰乱大局之计，岂共和国民当如是耶？……为此通令各省督、民政长，通行晓谕，须知刑事案件，应俟司法机关判决；外债事件确经前参议院赞同，岂容散布浮言，坐贻实祸。本大总统有维持治安之责，何敢坐视扰攘，致无以对我国民也。此令！”
袁世凯既然撕破了脸，公然向国民党寻衅，遂于2年5月15日，根据陆军部的呈文，下令取消huáng兴上将名衔，同时嗾使陕督张凤翙、晋督阎锡山、直督冯国璋、奉督张锡銮、鲁督周自齐、豫督张镇芳、护陇督张炳华及提督马安良、护军使张行志等，联名通电，毁诋huáng兴和赣、粤两督为：“不惜名誉，不爱国家，谗说横行，甘为戎首。”张作霖则指责huáng兴“倾覆政府，损害国体”。雷震chūn和赵倜则诬huáng兴因争总统不成而捣乱。而袁本人公然正面攻击孙中山和huáng兴。据5月24日《时报》所载：
“袁向其亲信说：现在看透孙、huáng，除捣乱外无本领。右又是捣乱，左又是捣乱，我受四万万人付托之重，不能以四万万人之财产生命听人捣乱，自信政治军事经验，外jiāo信用不下于人，若彼等力能代我，我亦未尝不愿，然今诚未敢多让。彼等若敢另行组织政府，我即敢举兵征伐之。国民党诚非尽是莠人，然其莠者，吾人未尝不能平之！袁作此语时，有梁士诒、段芝贵、曾彝进三人在座。梁嘱曾以个人资格往告国民党人，袁谓可即说是袁慰庭说的，我当负责任云云。”
袁有个习惯，他每次要有行动时，总要把北洋军搬出来炫耀一番，以达其先声夺人的目的。这时他也故计重施，采取了同一手腕，第一步骤是指使北洋军将领发表联合电报，痛骂以国民党为多数党的国会，对大借款问题无理取闹，不顾大体。第二步骤是专对huáng兴，硬说湖北季雨霖叛变是huáng兴所指使，张勋通电捏造huáng兴派人到兖州运动军队，把huáng兴说成是好乱性成的捣乱派。第三步骤是冯国璋、姜桂题、段芝贵、张勋等联名通电：“枕戈待命”。同时北洋系组织了七省联盟以对抗国民党的四省联盟。在一片疯狂叫嚣中，有人建议由各省军人推戴袁为中华民国正式大总统。
袁的军事部署是这样的：派倪嗣冲为安徽清乡督办，由河南向安徽边境进发；派毅军赵倜与第六师李纯两部集中河南、湖北jiāo界的武胜关；又派海军舰队游弋于九江上下游一带，其目的在进攻国民党控制下的江苏、安徽、江西三省。
5月15日取消huáng兴上将头衔，6月9日免江西都督李烈钧职，6月14日免广东都督胡汉民职，6月18日令粤汉川汉铁路由jiāo通部直辖，准督办岑chūn煊辞职，6月30日免安徽都督柏文蔚职。江西、广东、安徽省形式上是国民党的势力范围，而李烈钧、胡汉民、柏文蔚又都是国民党党员。
袁的这些行动，显示他已和国民党正式破裂，大局至此，遂不可收拾。
袁和国民党决裂后，举足轻重的是湖北的黎元洪。黎虽举足轻重，但他一直为国民党人所轻视，自张振武案后，更为国民党人所不谅，因此，在这两大势力之间黎必须选择一条路。由于张振武案他已入了袁的网罟，所以他在这战云弥漫时，向袁递上一道降表，中有：“元洪惟知服从中央，长江下游，誓死拄搘，决无瞻顾，倘渝此盟，罪在不赦！”袁给黎回电，极尽敷衍：“世凯若有欺天下之心，利一姓之见，罪亦不赦。”
这一对冤家，后来又变成了儿女亲家，现在则互相发誓以qiáng化互相勾结。袁、黎两人的勾结对于袁这次用兵的成败，是一个大关键。因为湖北居中国要冲，是南北战争的枢纽地带，黎元洪的倾向可以成为双方胜败重要关键之一，黎元洪既然敞开大门让北洋军进入湖北，所以第六师得以安全迅速地通过武胜关，一步一步移动到“长江之腰”的田家镇，矛头指向江西。
在6月9日袁撤免李烈钧的江西都督时，就同时发布命令，以黎元洪兼领江西都督事，以欧阳武为江西护军使，升授中将，以陈廷训为江西要塞司令，加中将衔。欧阳武和陈廷训都是江西将领。
袁的这道命令相当狠毒，用黎兼领江西都督，不但是眼前的借刀杀人计，而且也是未来的调虎离山计。因为目前这么做，使国民党更恨黎元洪，黎势必只有一面倒向袁的怀抱，待经过一段时间后，便可再发布一道人事命令，命黎专任江西都督，而免去其湖北都督的兼职，使黎离开他的根据地武昌。黎虽号称老实人，可是在对他自己有切身利害时，他是看得很清楚的，因此他坚决不肯“兼领”，并极力保举欧阳武继任江西都督。
黎既然表示拥护袁，于是乃致电huáng兴和胡汉民、李烈钧、柏文蔚等，电云：
“……元洪与诸公，昔为生死患难之jiāo，今为唇齿辅车之势，感赴援之厚谊，杯通好之真诚，区区此心，万不至舍旧谋新，去近图远。惟外观世局，内审国情，但知以国利民福为前提，以保育共和，维持统一为宗旨，不忍南北稍形决远行，友邦公认，诸公手造民国，永垂无上荣誉，否则内部茧裂，qiáng敌剖分，民国不成，诸公前此勋名，亦将安在？……元洪恃在夙好，敢贡罪言，情尽于斯，尚祈矜察。”
黎虽然向袁递了降表，可是促成袁、黎结合的，不能不归功于两个人，一个是章炳麟，一个是饶汉祥。
刺宋案闹得下不了台时，章曾给袁一函，其最后一段是：“诚能决心以去宵小，推诚以待人才，保全倡义之元勋，倚任武昌之夹辅，何不乐为？”这倚任武昌之夹辅，就是qiáng调袁必须和黎合作。以革命时期曾坐过牢，文名满天下，又有“民国弥衡”绰号的近代国学大师章炳麟，在湖北人心目中，不失为一个偶像，他的言论毫无问题是有极大影响力的，他独独垂青于袁，兼及黎氏，这种无形中的宣传力量，是能够使人盲从的。